Speiseeis wird vor dem Gefrieren entkeimt. Dabei muss jeder Hersteller strenge Hygienevorschriften einhalten. Entscheidend ist aber auch wie das verarbeitete Frischobst, Streusel oder gar Rohmilch gelagert und gehandhabt werden. Auch bei der Portionierung in Eisdielen und Cafés können mangelhaft gereinigte Geräte, wenn etwa der Eisportionierer in unreinem Wasser steht, zu einer Keimbelastung und -vermehrung führen. Vorhandene Erreger wie Salmonellen, Enterobacter oder Yersinien bleiben auch im gefrorenen Zustand lebensfähig und können unter Umständen Magen-Darm-Erkrankungen auslösen.

Dieser Gefahr versuchen die Überwachungsämter der Kreise und kreisfreien Städte durch risikoorientierte Kontrollen bei den Eisherstellern und -verkäufern vorzubeugen.

Die Lebensmittelüberwachung hat aber auch ein Auge auf die Kennzeichnungspflicht. Je nach Fettquelle müssen Speiseeissorten unterschiedlich bezeichnet werden: Cremeeis, Rahm- oder Sahneeis, Milcheis, Eiscreme oder Fruchteiscreme. Die Vorschriften gelten sowohl für industriell hergestellte Waren als auch für Eisdielen oder Cafés. Ebenso müssen die 14 wichtigsten Stoffe oder Erzeugnisse, die Allergien oder Unverträglichkeiten auslösen können, ausgewiesen werden. Rote und gelbe „Eisbomben“ enthalten oft E 102 Tartrazin, E 122 Azorubin (Carmiosin) und E 129 Allularot AC. Diese Farbstoffe müssen mit dem Hinweis „Kann Aktivität und Aufmerksamkeit bei Kindern beeinträchtigen“ gekennzeichnet werden. Das bei Kindern beliebte „Schlumpfeis“ hingegen oder die als Engelblau oder Himmelblau bekannten Eissorten können nach Ansicht der Prüfer ohne Bedenken genossen werden.